制药工程设计是对化学原料药、生物药、中药、制剂药和药用包装材料的生产厂或生产车间根据各类产品的特点进行合理的工程设计，尽管各类产品的工程设计细则不尽相同，但均遵循下列基本要求.
1、严格执行国家有关规范和规定以及国家药品监督管理局颁布的《药品生产质量管理规范》GMP）的各项规范和要求，使制药生产在环境、厂房与设施、设备、工艺布局等方面符合GMP要求。
2、选择最经济的工艺路线，即要求最经济地使用资金、原辅材料、动力资源、公用工程和人力。为此，必须进行工艺流程优化和参数优化工作。
3、设备选型宜选用先进、成熟、自动化程度较高的设备。
4、环境保护、消防、职业安全卫生、节能设计与制药工程设计同步，严格执行国家及地方有关的法规、法令。
5、对工程实行统一规划的原则，为合理使用工程用地并结合医药生产的特点，尽可能采用联片生产厂房一次设计，一期或分期建设。
6、工程的配套和辅助设施的配备均以满足项目工程生产需要为原则，并考虑与预留设施或发展规划的衔接
7、为方便生产车间进行成本核算和生产管理，一般各车间的水、电、汽、冷量单独计算，仓库、公用工程设施、备料以及人员生活用室统一设置，按集中管理模式考虑。
总之，制药工程设计是一项技术性很强的工作，其目的是要保证所建药厂符合GMP规范及其他技术法规，技术上可行，经济上合理安全有效，易于操作。
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