生物洁净室主要应用于医院手术室、病房、制药厂、生物安全实验室、畜禽舍等，下面笔者谈下生物洁净室的种类。

一、一般生物洁净室

一般生物洁净室主要控制有生命的微粒对操作对象的污染。其壁面材料应能经受各种灭菌剂的侵蚀，内部一般保持正压。其应用领域有制药企业、食品企业、疾病控制中心、医疗单位（洁净手术室、制剂室、无菌配置室等、实验动物房、相关的科研及教学实验等。

二、生物安全实验室

生物安全实验室又称生物安全洁净室，除了要求控制有生命的微粒对操作对象的污染外，还要求控制具有潜在危害的操作对象对操作人员及周围环境的污染。因此，在生物安全实验室中压差的控制更为重要，内部保持负压。可用于细菌、病毒的分析研究及基因重组、疫苗制备等生物工程。

按气流流型分类，洁净室可分为单向流洁净室（层流洁净室、非单向流洁净室（乱流洁净室）、辐（矢）流洁净室、混合流（局部单向流）洁净室。